现代女性内分泌失调的原因主要是由于本身有经、带、胎、产等特殊生理过程，日常生活中又肩负工作、家庭的双重压力，往往比其他人群更易受到风、寒、暑、湿、热等外邪的侵害，导致气机失调，脏腑功能失调，冲任病变。因为女性较敏感，情绪不稳定，又易因忧郁、急躁、怒气、思虑过度等内在因素扰乱气血运行，从而导致月经不调、痛经、不孕等女性内分泌失调疾病。
其病因有以下几种：
1．情志不遂。情志失调，如：肝气郁结、暴怒伤肝、思虑伤脾、惊恐伤肾，都可能使气机逆乱，气滞血淤，可导致黄褐斑、月经不调、痛经、不孕、子宫肌瘤、早衰等内分泌失调疾病。
2．劳伤脾土。饮食没有节制、劳倦过度、偏嗜五味（也就是偏好某种味道的食物），可使脾胃功能受阻，使水谷精微吸收受限，废物糟粕残留体内，从而引起各种内分泌失调症状。
3．肾虚也是引起女性内分泌失调的原因之一。
女人的生长、发育、生殖、衰老各阶段的生理过程与肾气盛衰紧密相关，女人一些特有的生理现象，经(月经)、带(白带)、孕(胎孕)、产(分娩)、乳(哺乳)等也与精气关系密切。女性以血为本，以气为用，气血是月经、孕育、哺乳的物质基础。肾藏精，精化血、化气，是经、孕、产、乳、带下的先决条件，只有肾气旺盛，经、孕、产、乳、带下功能才会正常。女性受生理、病理因素影响容易发生肾虚，如先天禀赋不足导致精气亏虚；房事过度，久伤阴精，或人到中年，肾精亏耗，肾阴虚或阳虚。可出现五心烦热、头晕耳鸣、失眠健忘、经少经闭、宫寒不孕等病症。
4．外感六邪。女性在经、胎、产等特殊生理过程中，易受到风、寒、暑、湿、热等外邪的侵害，导致气机失调、气血不和，从而导致多种女性内分泌失调症状。
人体内分泌系统是一个相当复杂的系统,它包括垂体、甲状腺、甲状旁腺、肾上腺、胰岛、胸腺、性腺、扁桃体等多个器官和组织。内分泌是人体生理机能的调控者，其功能是分泌各种激素,直接参与人体内多种物质的代谢和功能的调控。
由于人体是一个有机的整体，各系统、各脏器、各组织之间都是互相影响，有机配合，在内分泌系统的直接参与和调控作用下，使免疫系统维持其良好的监视、防卫、清除代谢产物和外来侵入者的尸体、修复受损的细胞、组织、器官，使其恢复原来的功能。另一方面，一个内分泌器官的功能失调，可以引起其它内分泌器官的功能改变，因而产生多个系统的病变可造成某些系统器官严重损害，甚至坏死，严重影响生活质量和心理健康。